《藍精靈》講述了邪惡的格格巫突然闖進精靈村莊，受驚的藍精靈慌忙躲避，笨笨誤闖神秘石洞，在奇異的藍月亮照耀下竟然穿越來到紐約中央公園。藍爸爸同藍妹妹、笨笨、聰聰、厭厭以及勇勇（新角色）在紐約這座大蘋果之城展開冒險。他們人生路不熟，只好寄居在一對年輕的溫斯洛夫婦家中，他們百厭活潑反應快，搞到屋主暈頭轉向又無計可施；而藍精靈們首要的任務就是避開格格巫的追捕返回精靈村莊。

在溫斯洛夫婦的幫助下，藍精靈們打敗了格格巫，并通過藍月亮下的旋窩成功返回精靈村莊。